2011年4月20日下午，我校与南京航空航天大学合作办学协议续签仪式在南京航空航天大学明故宫校区隆重举行。在副校长王心如教授的带领下，我校校办、教务处、学生工作处、财务处、第一临床医学院的主要负责人出席了签约仪式。南京航空航天大学吴庆宪副校长代表南航向与会人员表示了热烈的欢迎。南航党政办、教务处、财务处、学生工作处、材料与技术学院等部门的主要负责人均参加了签字仪式。
为了深化教育教学改革，推进高等学校之间教育资源共享，提高教学质量和办学效益，南京医科大学、南京航空航天大学于2005年5月本着“平等互利、优势互补、相互促进、共同发展”的原则，开始合作探索，共同培养七年制高等医学人才。截至目前，我校已有6届共914名七年制学生在大学一年级期间就读南京航空航天大学；南京航空航天大学生物医学工程专业共有5批88名学生在我校第一附属医院进行过为期1个月左右的实践学习。
经过六余年的精诚合作，两校不仅在人才培养方面取得了可喜的成绩，在办学理念、办学思路等方面也达成了很多共识。经双方协商，均表示愿意在原有工作基础上进一步将合作办学事宜向纵深推进，继续探索新的合作模式，不断提高人才培养质量，进一步发挥南京航空航天大学理、工学科实力雄厚和我校医学学科齐全的优势，在复合型人才上争创典范，多出精品。
王心如副校长代表学校对南京航空航天大学多年来对我校教育教学和人才培养工作给予的大力支持表示感谢的同时，也对今后的合作事宜寄予厚望。南京航空航天大学吴庆宪副校长真诚表示，将一如既往地与我校合作，不断探索合作新路子，共同为推进我国高等教育事业的发展做出新的贡献。
最后，两校领导签署了合作办学协议书，就此揭开南京医科大学和南京航空航天大学合作办学新的篇章。
